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1.结构的不同
传统工控机一般采用便于安装的4U类型标准机箱，机箱采用钢结构，有较高的防磁、防尘、防冲击的能力。机箱内有专用底板，底板上有PCI和ISA插槽。机箱内有专门电源，电源有较强的抗干扰能力 ，具有连续长时间工作的能力。
无风扇嵌入式工控机采用的是全铝面板和嵌入式主板，先进而坚固的机构设计能够承受冲击、振动、湿度和高低温的极限环境。
2.工业级元器件
使用工业级元器件，不但提供卓越的性能，降低了系统内部的发热量，同时也增加了系统的稳定性。
3.特殊的散热
特制散热模块和机构设计为有效的散热提供的保障，加了系统操作温度的上限，也提高了工业级产品的品质和标准。
4、功能的不同
传统工控机由CPU卡驱动无源底板上的相关接口卡，CPU卡与相关外设卡这间的信号走线长，存在信号衰减与干扰,传统工控机对于更先进的外设没有预留接口。
无风扇嵌入式系统具有可丰富扩展性。系统支持各种扩展接口，如PCI、PCIExpress、MINIPCIe和mSATA，为许多不同的工业应用提供了最大的灵活性。高性能系列还支持4个POE端口，POE功能允许数据通过以太网电缆传输，使系统可用于IEEE802.3af标准的电源设备，减少了复杂性、安装和维护成本，同时增加了网络的安全性和可靠性。
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